Modulation du microbiote dans le côlon irritable – pertinent ou non?

Chez la plupart des patients atteints du syndrome du côlon irritable (SCI), une dysbiose intestinale, c’est-à-dire un déséquilibre qualitatif et quantitatif du microbiote intestinal, peut être mis en évidence. Il existe différentes possibilités ciblées pour la modulation du microbiote.

Le syndrome du côlon irritable (SCI) est le trouble fonctionnel du tractus gastro-intestinal le plus fréquent.¹ Il s’accompagne d’un certain nombre de troubles physiopathologiques, tels qu’une augmentation de la perméabilité de la barrière intestinale, un trouble du système immunitaire local, une sécrétion anormale, une sensibilité viscérale accrue, une motilité intestinale pathologique, un déséquilibre du microbiote intestinal et, enfin, des comorbidités psychiatriques concomitantes, telles que la dépression ou le trouble anxieux.²

Origine du côlon irritable et dysbiose intestinale

Le SCI se caractérise en premier lieu par une dysfonction de l’axe intestin-cerveau (AIC), c’est-à-dire une communication bidirectionnelle entre les systèmes nerveux entérique et central (Fig.1).³ La plupart des patients atteints du SCI présentent une dysbiose intestinale, c’est-à-dire un déséquilibre qualitatif et quantitatif du microbiote qui a un impact négatif sur l’activité de l’AIC. À cela s’ajoutent de nombreuses modifications du microenvironnement de la muqueuse intestinale (p.ex. l’activation des mastocytes avec augmentation de la libération d’histamine, troubles du système immunitaire inné et adaptatif). Suite à ces processus pathologiques, une micro-inflammation se développe dans la muqueuse des patients concernés. Tout cela peut entraîner l’apparition des symptômes du côlon irritable.⁴

Fig. 1: Influence de la dysbiose intestinale sur l’axe intestin-cerveau (AIC) et options thérapeutiques de modulation du microbiote

Cette apparition est multifactorielle. En premier lieu, de nombreuses études ont pu mettre en évidence des modifications quantitatives et qualitatives du microbiote intestinal dans le cas du côlon irritable. Les analyses du microbiome fécal des patients concernés montrent une réduction significative des bactéries commensales (p.ex. bifidobactéries, lactobacilles), mais une augmentation significative des taxons bactériens pro-inflammatoires, tels que les Enterobacteriaceae.⁵

Les conséquences de la dysbiose intestinale ne sont pas seulement des modifications structurelles du microbiote intestinal, mais aussi des changements significatifs dans la production de métabolites microbiens. Récemment, un groupe de travail de Göteborg a mis en évidence une différence significative entre les profils des métabolites chez les patients atteints du SCI et ceux des témoins sains.⁶

Les mécanismes exacts qui conduisent à la dysbiose intestinale n’ont pas été suffisamment clarifiés jusqu’à présent. Les études de ces dernières années fournissent une série de preuves démontrant que l’exposition des femmes enceintes ou des enfants, dans les premiers mois suivant la naissance, aux antibiotiques, au stress ou à une mauvaise alimentation, en plus de la prédisposition génétique, peut favoriser la survenue du SCI.⁷ D’autre part, les infections jouent également un rôle extrêmement important en tant qu’élément déclencheur; on parle de SCI post-infectieux.⁸ Environ 10% de tous les cas de côlon irritable peuvent être attribués à cette cause. Le SCI post-Covid en est un exemple. Il se caractérise par des douleurs abdominales récurrentes et réfractaires au traitement dues à une hypersensibilité viscérale accrue et à une modification de la motilité intestinale.⁹

Modulation du microbiote

La modulation du microbiote constitue une approche prometteuse du SCI (Fig.1). Il s’agit notamment de l’utilisation d’antibiotiques, de probiotiques, de prébiotiques, de symbiotiques, de postbiotiques et de la transplantation de microbiote fécal.¹⁰

Une option thérapeutique prometteuse est l’utilisation de la rifaximine. Il s’agit d’un antibiotique à large spectre non absorbable qui module positivement le microbiote intestinal et améliore les symptômes, surtout en cas de SCI avec diarrhée.¹¹

D’autre part, les médecins ont également à leur disposition de nombreux probiotiques. Ces bactéries positives renforcent la fonction de barrière, ont une influence positive sur l’immunomodulation, présentent des effets anti-inflammatoires et inhibent également l’invasion de bactéries pro-inflammatoires.¹² De nombreuses études randomisées menées avec des probiotiques par rapport à un placebo mettent en évidence un effet positif de ce traitement.¹³

Les aliments fermentés, appelés probiotiques naturels, tels que le kimchi, la choucroute, le miso, le natto, le réjuvélac, le kombucha, le kéfir ou le yaourt, peuvent également avoir une influence positive sur la composition et la fonction des bactéries intestinales.¹⁴

Outre les probiotiques, les prébiotiques jouent un rôle important dans le traitement des patients atteints du SCI. Ce sont des composants alimentaires non digestibles (p.ex. inuline, xylo-oligosaccharides ou fructo-oligosaccharides) qui ont un effet positif sur leur hôte en stimulant spécifiquement la croissance et/ou l’activité d’une ou de plusieurs espèces de bactéries dans le côlon, améliorant ainsi la santé de l’hôte. Ils stimulent la production d’acides gras à chaîne courte, augmentent la biomasse dans l’intestin, fournissent plus d’énergie aux cellules du côlon et, enfin, inhibent également la croissance des bactéries négatives et peuvent avoir un effet positif sur l’évolution du pH dans l’intestin. Les prébiotiques sont aussi présents dans différents aliments, tels que l’endive, le topinambour, l’artichaut, le poireau, l’oignon ou le salsifis. Les prébiotiques et les probiotiques peuvent être associés pour obtenir un symbiotique ayant un effet renforcé sur l’immunomodulation et les réactions métaboliques dans l’intestin.¹⁵

Les postbiotiques constituent une autre option pour la modulation du microbiote intestinal. Il s’agit de micro-organismes inanimés ou de leurs composants, ou de certains produits métaboliques (p.ex. butyrate). Le principal effet des postbiotiques est de renforcer le système immunitaire local et d’améliorer la fonction de la barrière intestinale.¹⁶

La transplantation de microbiote fécal (c’est-à-dire le transfert de selles d’un donneur sain dans l’intestin d’un patient malade par endoscopie ou capsules) est une autre possibilité pour modifier la composition du microbiote intestinal. La FMT permet en premier lieu d’améliorer la diversité du microbiote. Il s’agit toutefois d’une méthode complexe qui nécessite une préparation en laboratoire ainsi que la sélection d’un donneur sain approprié.¹⁷ Les méta-analyses montrent des résultats très variables, allant de négatifs à positifs, en fonction de la dose, de la durée du traitement et de la voie d’administration (voie gastro-intestinale supérieure par rapport à inférieure).¹⁸

Enfin, un régime pauvre en FODMAP (low FODMAP), c’est-à-dire en oligosaccharides, disaccharides, monosaccharides et polyols fermentescibles, constitue également une option importante pour la modulation du microbiote intestinal. Ce type de régime alimentaire a un effet favorable sur les symptômes du côlon irritable,¹⁹ son efficacité est d’ailleurs confirmée par les méta-analyses de nombreuses études. Il se déroule en trois phases: élimination, test de tolérance et alimentation à long terme. C’est pourquoi les patients concernées ont besoin de l’aide de diététiciens.